پیش بینی ژن روش‌ها و پروتکل‌ها

قوتی, شاهرخ; گل پسند, ساره

doi:10.22124/psug.2025.27208.1066

پیش بینی ژن روش‌ها و پروتکل‌ها

نوع کتاب : ترجمه

نویسندگان

¹ گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، گیلان، ایران

² گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

10.22124/psug.2025.27208.1066

چکیده

مطالعه RNA غیر کدکننده (ncRNA) در حال حاضر در هر طرح ژنومیک یا رونویسی امر عادی است. ncRNA‌ها را با توجه به عملکردشان، می‌توان به چندین خانواده RNA مختلف دسته‌بندی کرد که می‌توانند با توالی‌های اولیه حفاظت شده، ساختارهای ثانویه یا مدل‌های کوواریانس (CMs) نمایش داده شوند. مدل‌های کوواریانس در پیش‌بینی خانواده‌های RNA در توالی‌های نوکلئوتیدی بسیار حساس هستند و به طور گسترده در توصیف مجموعه‌ای ازncRNAها در جانداران از همه شاخه های زیستی استفاده شده‌اند. با این حال، پیش‌بینی و حاشیه‌نویسی مقیاس بزرگ ncRNAها به ابزارهای متعددی در طول فرآیند نیاز دارد، که مانع بزرگی برای محققان با پیش‌زمینه محاسباتی یا بیوانفورماتیک ضعیف، ایجاد می‌کند.
StructRNAfinder به عنوان یک ابزار خودکار برای جلوگیری از این محدودیت‌ها، با شناسایی خودکار (اتوماتیک) حاشیه‌نویسی کامل خانواده‌های RNA تنظیمی که مستقیماً از توالی‌های نوکلئوتیدی مشتق شده‌اند، پدیدار شد. در این فصل، ما یک آموزش کامل برای هر دو نسخه مستقل و وب سرور StructRNAfinder ارائه می‌دهیم. این امر، به کاربران کمک می‌کند تا ابزار را نصب کنند و پیش‌بینی خانواده‌های RNA را در هر مجموعه از داده ژنوم یا توالی رونویسی انجام دهند.

جلد کتاب